مصطفی پورمحمدی، وزیر دادگستری، در واکنش به نامه علی مطهری که از او خواسته بود درباره اعدام‌های سال ۶۷ توضیح دهد گفت: «افتخار می‌کنیم که دستور خدا را در رابطه با منافقین اجرا کردیم.» انتشار فایل صوتی جلسه دیدار آیت‌الله منتظری با مصطفی پورمحمدی (نماینده وقت وزارت اطلاعات در زندان اوین)، حسینعلی نیری (حاکم شرع وقت)، مرتضی اشراقی (دادستان وقت) و ابراهیم رئیسی (معاون وقت دادستان) در تاریخ ۲۴ مرداد ۱۳۶۷ همچنان با واکنش روبروست.
علی مطهری، نماینده و نایب رئیس مجلس شورای اسلامی، از پورمحمدی خواسته بود به جای “مغالطه” در این باره توضیح داده و روشنگری کند. پورمحمدی که برای بازدید از لرستان به خرم آباد رفته، در جمع خبرنگاران و در پاسخ به خبرنگاری که نظر او را درباره نامه مطهری پرسید گفت: «خداوند فرمودند بر کفار رحم نکنید چون آنها به شما رحم نمی‌کنند و به منافقان نباید رحم کرد چرا که اگر بتوانند شما را به خاک و خون می کشند که کشیدند.» او ادامه داد: «ما افتخار می کنیم که دستور خدا را در رابطه با منافقین اجرا کردیم.»
وزیر دادگستری دولت حسن روحانی همچنین در دفاع از حکم آیت‌الله خمینی برای اعدام مجاهدین و نیروهای چپ زندانی گفت: «امام راحل به ما یاد داد که در زمین دشمن بازی نکنیم و صحنه مبارزه را ما تعیین می‌کنیم و خودمان نقشه بکشیم.»پورمحمدی تصریح کرد که با همین “نقشه” بود که جمهوری اسلامی توانست کشور را “از دشمنی و شر دشمنان، صهیونیست‌ها و منافقین” نجات دهد. دو روز پیش علی مطهری طی نامه‌ای خطاب به پورمحمدی نوشت: « با توجه به اینکه از نظر اسلام و در حکومت اسلامی حتی به چنین جانیانی و طرفداران آنها نیز نباید ظلم شود آیا شایعاتی که درباره اتفاق سال ۶۷ درباره نحوه اجرای حکم امام (ره) گفته می‌شود صحت دارد یا خیر؟»
پورمحمدی پیشتر در دفاع از اعدام‌های سال ۶۷ گفته بود: «گروهی قصد دارند مجاهدین خلق را تطهیر کنند. اگر جدیت نیروهای انقلابی در آن زمان نبود نمی‌شد مقابل ضد انقلاب، گروهک‌ها و مجاهدین خلق ایستاد.» در مرداد ۱۳۶۷ و پس از پذیرش قطعنامه ۵۹۸ از سوی ایران و پایان گرفتن جنگ هشت ساله با عراق، به دستور آیت‌الله خمینی تعداد زیادی از زندانیان سیاسی که محاکمه شده و در حال گذراندن احکامشان بودند و برخی حتی حکمشان پایان گرفته بود پس از حضور در دادگاه‌هایی چند دقیقه‌ای اعدام شدند.
پورمحمدی درباره اعدام های ۶۷: خداوند گفت به کفار رحم نکنید؟!
